โรงพยาบาลแม่ออน ได้ดำเนินการพัฒนาคุณภาพมาอย่างสม่ำเสมอ
ซึ่งปัจจุบัน ได้ผ่านการธำรงขั้นสองมาแล้วถึง 4 ครั้ง
ในวันที่ 23 เมษายน พ.ศ. 2558 จะได้รับการเยี่ยมประเมินเพื่อธำรงขั้นสองเป็นครั้งที่ 5
โดยเน้น การทบทวน การพัฒนาอย่างต่อเนื่อง ความปลอดภัย การบริหารจัดการทางยา การบริหารความเสี่ยง การป้องกันและควบคุมการติดเชื้อ และสิ่งแวดล้อมเพื่อความปลอดภัย หน่วยงานห้องฉุกเฉิน หอผู้ป่วยใน ห้องยา การกำจัดขยะ สิ่งแวดล้อมในโรงพยาบาล และหน่วยงานต่างๆ
